| RUNX2 | Q13950 | ZNF562-201 | ENST00000293648 | 12380 nt | TSL 2 BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABCA12-201 | ENST00000272895 | 9100 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C17orf78-204 | ENST00000615133 | 1862 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC44A5-201 | ENST00000370855 | 4406 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MPDZ-215 | ENST00000541718 | 7603 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIF21A-201 | ENST00000361418 | 5044 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079062.1-203 | ENST00000581862 | 3610 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FANCD2-202 | ENST00000383807 | 5102 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCB4-203 | ENST00000378493 | 5796 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CDH9-201 | ENST00000231021 | 3079 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APC-207 | ENST00000508376 | 10619 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CKS1B-201 | ENST00000308987 | 759 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-40P-201 | ENST00000364351 | 143 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP505-201 | ENST00000364748 | 108 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS16P5-201 | ENST00000406501 | 404 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUP35P2-201 | ENST00000416748 | 943 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS3AP9-201 | ENST00000417027 | 792 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL122034.1-201 | ENST00000427609 | 497 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NPM1P34-201 | ENST00000428821 | 893 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | YWHAZP7-201 | ENST00000436906 | 631 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137076.1-201 | ENST00000441046 | 551 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P2-201 | ENST00000442927 | 1142 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011753.3-201 | ENST00000443436 | 406 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC122136.1-201 | ENST00000443971 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161937.1-201 | ENST00000444478 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161621.1-201 | ENST00000444796 | 340 nt | TSL 3 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAMSN1-AS1-201 | ENST00000449214 | 840 nt | TSL 3 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCSP34-201 | ENST00000458172 | 304 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | COX7A2-205 | ENST00000460985 | 357 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591473.1-201 | ENST00000464297 | 313 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007686.1-201 | ENST00000488511 | 463 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093752.1-212 | ENST00000500559 | 453 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLRA1P-201 | ENST00000503499 | 986 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093895.1-203 | ENST00000506814 | 591 nt | TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P23-201 | ENST00000509838 | 286 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027309.2-201 | ENST00000520566 | 192 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022882.1-201 | ENST00000532142 | 501 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCSP28-201 | ENST00000534284 | 321 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NRG3-205 | ENST00000537893 | 1174 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02378-201 | ENST00000540399 | 1003 nt | TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL929601.2-201 | ENST00000549951 | 381 nt | TSL 4 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC137768.1-201 | ENST00000549998 | 553 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025035.1-201 | ENST00000551571 | 894 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MMP2-AS1-201 | ENST00000565307 | 593 nt | TSL 4 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087501.4-201 | ENST00000574460 | 235 nt | TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF230-204 | ENST00000585632 | 579 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092296.3-201 | ENST00000589968 | 249 nt | TSL 3 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02109-204 | ENST00000602801 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC133552.5-201 | ENST00000604266 | 540 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091946.2-201 | ENST00000606105 | 291 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589740.1-208 | ENST00000606913 | 812 nt | TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC243829.4-202 | ENST00000610845 | 410 nt | TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005332.6-201 | ENST00000613178 | 446 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NCRUPAR_2.1-201 | ENST00000616308 | 99 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000843.1-201 | ENST00000624880 | 701 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL596275.2-204 | ENST00000641628 | 552 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL596275.2-206 | ENST00000641957 | 626 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108751.5-201 | ENST00000492880 | 1336 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCGB2A2-202 | ENST00000525380 | 1305 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SGIP1-204 | ENST00000371039 | 4080 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CSRNP3-201 | ENST00000314499 | 11788 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF445-201 | ENST00000396077 | 18299 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UTS2B-201 | ENST00000340524 | 2395 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TCEANC-201 | ENST00000380600 | 2988 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR51H2P-202 | ENST00000641424 | 3046 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | POLR2B-203 | ENST00000431623 | 3666 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEC31A-237 | ENST00000513858 | 3687 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP29-202 | ENST00000598197 | 3284 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRIM36-209 | ENST00000514154 | 1952 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGEF12-202 | ENST00000397843 | 9660 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FCHSD2-205 | ENST00000409853 | 1867 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZC3H14-215 | ENST00000555900 | 1762 nt | TSL 5 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C12orf50-203 | ENST00000550553 | 1525 nt | TSL 5 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPR18-202 | ENST00000397470 | 1468 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107982.1-201 | ENST00000507171 | 1300 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAJC12-201 | ENST00000225171 | 1201 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA71.2-201 | ENST00000364941 | 134 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.311-201 | ENST00000365068 | 96 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DFNB59-201 | ENST00000375129 | 1202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR659-201 | ENST00000384963 | 97 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CXADR-203 | ENST00000400165 | 603 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL450338.1-201 | ENST00000407987 | 512 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLK1-203 | ENST00000409769 | 1192 nt | TSL 2 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP216-201 | ENST00000411050 | 312 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121885.1-201 | ENST00000417957 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391807.1-202 | ENST00000419979 | 534 nt | TSL 2 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL020993.1-201 | ENST00000420172 | 297 nt | TSL 3 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069213.2-201 | ENST00000420238 | 366 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP26-201 | ENST00000421008 | 661 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P1-205 | ENST00000422088 | 832 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL451127.1-201 | ENST00000422909 | 624 nt | TSL 3 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL593851.1-201 | ENST00000426171 | 157 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL36P19-201 | ENST00000430744 | 301 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARL6IP1P2-201 | ENST00000431356 | 563 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162419.1-201 | ENST00000440674 | 873 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND2P22-201 | ENST00000444325 | 1033 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512303.1-201 | ENST00000458693 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL5P23-201 | ENST00000496040 | 868 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01181-201 | ENST00000503718 | 556 nt | TSL 4 BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNX5P1-201 | ENST00000505757 | 1041 nt | BASIC | 4.33 | □□□□□ -1.72 | | |