Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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