Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms