Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IRF9Q00978 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms