Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA13P31271 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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