Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PTPRMP28827 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PTPRMP28827 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PTPRMP28827 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPRMP28827 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPRMP28827 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRMP28827 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRMP28827 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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