Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn6Q9Z262 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn6Q9Z262 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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