Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Padi1Q9Z185 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms