Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scnn1gQ9WU39 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1gQ9WU39 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms