Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trex2Q9R1A9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trex2Q9R1A9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms