Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms