Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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Tmod4Q9JLH8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Tmod4Q9JLH8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Tmod4Q9JLH8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Tmod4Q9JLH8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Tmod4Q9JLH8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmod4Q9JLH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmod4Q9JLH8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmod4Q9JLH8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tmod4Q9JLH8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tmod4Q9JLH8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tmod4Q9JLH8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod4Q9JLH8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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