Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms