Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP3Q9H4L4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms