Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin37Q9D8N6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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