Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn3Q9CVD2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms