Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms