Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms