Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc18Q9CQ07 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms