Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms