Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gins4Q99LZ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms