Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms