Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Smim11aQ99J19 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Smim11aQ99J19 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Smim11aQ99J19 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Smim11aQ99J19 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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