Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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