Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms