Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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