Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfflQ6ZQM0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms