Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms