Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms