Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk4Q3V016 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms