Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms