Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmem253Q3UNB8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmem253Q3UNB8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmem253Q3UNB8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmem253Q3UNB8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem253Q3UNB8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tmem253Q3UNB8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tmem253Q3UNB8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem253Q3UNB8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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