Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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