Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms