Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms