Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx2P48031 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms