Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms