Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp4P35123 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms