Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms