Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms