Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PcnaP17918 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnaP17918 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms