Protein–RNA interactions for Protein: P0C1V4

Tmco2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco2P0C1V4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco2P0C1V4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco2P0C1V4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms