Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms