Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3aO88508 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3aO88508 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms