Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms