Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-ObO35424 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-ObO35424 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-ObO35424 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-ObO35424 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-ObO35424 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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H2-ObO35424 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-ObO35424 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-ObO35424 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-ObO35424 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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