Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20918J3QN17 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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