Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms