Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms