Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms